申请取保候审后案件的处理流程一般如下：
侦查阶段
继续侦查：取保候审并不意味着侦查机关停止对案件的侦查。公安机关会继续收集、固定证据，查明案件事实。在这期间，被取保候审人需要遵守相关规定，如未经执行机关批准不得离开所居住的市、县；住址、工作单位和联系方式发生变动的，在二十四小时以内向执行机关报告等。
补充侦查：如果公安机关在侦查过程中发现证据不足或存在其他问题，可能会进行补充侦查，进一步收集证据以完善案件材料。
审查起诉阶段
移送审查起诉：侦查终结后，公安机关会将案件移送至人民检察院审查起诉。检察院会对案件的证据材料进行全面审查，包括证据的合法性、真实性和关联性等。
讯问犯罪嫌疑人：检察院在审查起诉期间，应当讯问犯罪嫌疑人，听取其供述和辩解，并告知其在审查起诉阶段的权利义务。犯罪嫌疑人可以在此阶段委托辩护人，辩护人可以为其提供法律帮助和辩护意见。
退回补充侦查或不起诉决定：如果检察院认为案件证据不足，可能会将案件退回公安机关补充侦查，公安机关需要在规定时间内补充侦查完毕并再次移送审查起诉，补充侦查以二次为限。如果检察院认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或者犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，可以作出不起诉决定。
审判阶段
提起公诉与开庭审理：如果检察院经审查认为犯罪嫌疑人的犯罪事实清楚，证据确实、充分，应当依法向人民法院提起公诉。法院在受理案件后，会确定开庭日期并通知被告人、辩护人、公诉人等诉讼参与人。在庭审过程中，被告人有权进行辩护，辩护人可以为其提供辩护意见，公诉人会出示证据并指控犯罪，双方可以进行质证和辩论。
作出判决：法院在审理后，会根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出有罪判决、无罪判决或者证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。如果被告人被判处缓刑，在判决生效后，被告人需按照规定执行缓刑；如果被判处实刑，被告人则需要被收监执行刑罚。
案件后续处理
解除取保候审：如果案件在侦查、审查起诉或审判过程中，发现不应追究刑事责任或者取保候审期限届满，办案机关应当及时解除取保候审，并通知被取保候审人和有关单位。对于被解除取保候审的人，如果在取保候审期间未违反规定，保证金会如数退还。
执行判决或其他处理：如果被告人被判决有罪并判处刑罚，在判决生效后，由执行机关按照判决内容执行刑罚。如果被告人对判决不服，可以在法定期限内向上一级人民法院提出上诉。如果检察院认为判决有误，也可以依法提出抗诉。